两天之后，陈源把父母和弟弟送上了离开珈蓝星的飞船，那是一艘去外星观光旅游的飞船，陈源担心如果他用移民的名义给家人买票，会被元帅府的人阻止，毕竟他的家人如果一直留在珈蓝星，元帅府就能以此更好地控制他，但如果他的家人都移民了，元帅府能威胁他的就少太多了。西历2059年，计划寻找新天地的银河移民船团“macross frontier”上，一名以驾驶员为目标而努力的少年早乙女阿尔特感受到了前所未有的闭塞感。这个时候，位于银河顶端的歌姬雪莉露·诺姆来到船团举行巡回演唱会，阿尔特以及憧憬着雪莉露的少女兰花·李当天都来到了会场。 然而演唱会当中，却突然遭到重机架生命体的袭击。为了保护少女们，阿尔特登上了最新型可变战斗机VF-25。在战火烽烟的尽头，传说中可以震撼宇宙的“歌”以及纠缠着少女们的“迷”究竟是什么……？
